Бумага надёжнее. И защита лучше как с "потерять" так и с "подправить". Помнится рассказывали про одного спеца, который делал банкам EC карты, насмотрелся и теперь делает всё на бумаге.

Файлы - кстати, это из хранения бухгалтерского пошло. Полно людей, у которых папками стеллажи заставлены с пола до потолка. В компьютере они такую же структуру делают и находят быстро.