ерунда.
- чтите gpl. если вы не вносите правок в исходный код MySQL, не линкуете его библиотеки в свой софт, вы не обязаны покупать коммерческие лицензии.
а если и да - то, продаете свою программу за все те же деньги. только вот ту часть кода, который вами был изменен в MySQL - должны предоставить пользователям под лицензией gpl.
соединение с сервером MySQL в эти определения не входит.