В том то и прелесть, что фреймворки можно найти на любой вкус.

Ребе, на сегодняшний день в J2EE главное - не использовать некоторые вещи, составляющие основу J2EE ;) Например, Entity Beans. Потому как доступ к базе делается гораздо лучше на других фреймворках(iBatis, или Hibernate, но Hibernate гораздо хуже).

Если нужно именно middle tier - чтобы поднять вебсервис подойдёт вполне Tomcat. Хочется JMS и прочих сложностей - Glasfish.

И не юзайте spring с его извращённой конфигурацией.