Проблема, в общем, не новая. Комбинирование разных версий софта с разными версиями библиотек влечет за собой проявление ошибок. Есть хороший костыль, как решают проблему в стабильной версии Debian - берут самые свежие версии всех библиотек и программ, фиксируют их, "отстаивают" и обкатывают, выявляя и исправляя возникающие ошибки. После года отстойки дистрибутив релизят, и все начинается по новой.