Да, как минимум, не придется плясать с бубном вокруг разрешений на выполнение, виртуальных машин, интеграции всей этой хрени в систему, итд.
Пока что практика показывает, что нативные приложения ведут себя лучше, чем дотнетовские. Да еще и микрософт своими плясками вокруг собственных же технологий раздражает.